Di musim kedua Aldnoah.Zero, konflik antara Bumi dan Mars mencapai puncaknya setelah peristiwa dramatis di musim sebelumnya. Setelah serangan yang menghancurkan dari pasukan Mars yang dipimpin oleh Count Saazbaum, pasukan Bumi berjuang untuk bertahan dan membalas dendam. Sementara itu, Inaho Kaizuka dan rekan-rekannya dari Bumi terus berjuang untuk melawan pasukan musuh yang kuat.
Dalam perjalanan mereka, Inaho dan teman-temannya menemukan bahwa ada kekuatan yang lebih besar di balik konflik antara Bumi dan Mars, dengan intrik politik yang rumit dan rahasia-rahasia yang tersembunyi. Sementara itu, Asseylum Vers Allusia, putri Mars yang selamat dari serangan sebelumnya, berusaha untuk membangun perdamaian antara dua planet tersebut meskipun tantangan besar yang dihadapinya.
Dengan konflik yang semakin memanas dan intrik-intrik politik yang semakin rumit, Inaho dan rekan-rekannya harus menghadapi berbagai rintangan dan memutuskan di mana kesetiaan mereka benar-benar berada. Dalam upaya mereka untuk melawan pasukan Mars yang kuat dan mempertahankan kedamaian di Bumi, mereka juga harus menghadapi konflik internal dan pertanyaan moral yang sulit.
Aldnoah.Zero Season 2 menawarkan kelanjutan yang mendebarkan dari cerita yang menggugah pikiran, dengan kombinasi aksi yang memukau, plot yang kompleks, dan karakter-karakter yang kuat. Dengan mengeksplorasi tema-tema seperti persahabatan, pengorbanan, dan keadilan, anime ini menawarkan pengalaman yang memikat bagi para penggemar cerita fiksi ilmiah dan pertempuran mecha.